MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 137095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002944	CGGC	2	8	185193	185200	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
5002	NC_002944	CCG	2	6	185260	185265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
5003	NC_002944	GCC	2	6	185274	185279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
5004	NC_002944	GCG	2	6	185288	185293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5005	NC_002944	GGC	2	6	185328	185333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5006	NC_002944	GCA	2	6	185347	185352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5007	NC_002944	CTG	2	6	185357	185362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5008	NC_002944	CCGCG	2	10	185412	185421	0 %	0 %	40 %	60 %	41406276
5009	NC_002944	ATC	2	6	185424	185429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406276
5010	NC_002944	GCGCC	2	10	185431	185440	0 %	0 %	40 %	60 %	41406276
5011	NC_002944	CCA	2	6	185443	185448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
5012	NC_002944	GCC	2	6	185449	185454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
5013	NC_002944	GCG	2	6	185457	185462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5014	NC_002944	GAC	2	6	185481	185486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5015	NC_002944	GTC	2	6	185528	185533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5016	NC_002944	GCA	2	6	185545	185550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5017	NC_002944	CGG	2	6	185572	185577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5018	NC_002944	ACC	2	6	185613	185618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
5019	NC_002944	CCGGC	2	10	185652	185661	0 %	0 %	40 %	60 %	41406276
5020	NC_002944	CCGA	2	8	185679	185686	25 %	0 %	25 %	50 %	41406276
5021	NC_002944	GCG	2	6	185760	185765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5022	NC_002944	CCA	2	6	185767	185772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
5023	NC_002944	GC	4	8	185830	185837	0 %	0 %	50 %	50 %	41406276
5024	NC_002944	GGC	2	6	185916	185921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5025	NC_002944	CTG	2	6	185948	185953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5026	NC_002944	GC	3	6	186030	186035	0 %	0 %	50 %	50 %	41406276
5027	NC_002944	GCCC	2	8	186079	186086	0 %	0 %	25 %	75 %	41406276
5028	NC_002944	TCG	2	6	186102	186107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5029	NC_002944	CCA	2	6	186121	186126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
5030	NC_002944	CGG	2	6	186191	186196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5031	NC_002944	CAC	3	9	186197	186205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
5032	NC_002944	CGG	2	6	186222	186227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5033	NC_002944	GCC	2	6	186282	186287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
5034	NC_002944	CAC	2	6	186290	186295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
5035	NC_002944	GCC	3	9	186296	186304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
5036	NC_002944	GGC	2	6	186316	186321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
5037	NC_002944	GTC	2	6	186335	186340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
5038	NC_002944	GGC	2	6	186435	186440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_002944	TGC	2	6	186462	186467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406277
5040	NC_002944	ACC	2	6	186494	186499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406277
5041	NC_002944	CGG	2	6	186525	186530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
5042	NC_002944	CAT	2	6	186541	186546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406277
5043	NC_002944	ACG	2	6	186570	186575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406277
5044	NC_002944	CGG	3	9	186585	186593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
5045	NC_002944	GCGCC	2	10	186606	186615	0 %	0 %	40 %	60 %	41406277
5046	NC_002944	CGG	2	6	186627	186632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
5047	NC_002944	CG	3	6	186685	186690	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
5048	NC_002944	TGG	2	6	186702	186707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406277
5049	NC_002944	CG	3	6	186724	186729	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
5050	NC_002944	GC	3	6	186735	186740	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
5051	NC_002944	GAA	2	6	186760	186765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406277
5052	NC_002944	CGC	2	6	186791	186796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406277
5053	NC_002944	AGC	2	6	186863	186868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406277
5054	NC_002944	CAC	2	6	186874	186879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406277
5055	NC_002944	GTC	2	6	186943	186948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406277
5056	NC_002944	CAG	2	6	186979	186984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406277
5057	NC_002944	CGG	2	6	186990	186995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
5058	NC_002944	TCG	2	6	187019	187024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406277
5059	NC_002944	GC	3	6	187058	187063	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
5060	NC_002944	CGG	2	6	187071	187076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
5061	NC_002944	GCC	2	6	187215	187220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
5062	NC_002944	CCA	2	6	187243	187248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406278
5063	NC_002944	CGC	2	6	187269	187274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
5064	NC_002944	GGC	2	6	187284	187289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406278
5065	NC_002944	TCCGAC	2	12	187323	187334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	41406278
5066	NC_002944	AGG	2	6	187417	187422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406278
5067	NC_002944	GTG	2	6	187470	187475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406278
5068	NC_002944	GCC	2	6	187476	187481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
5069	NC_002944	ACG	2	6	187525	187530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5070	NC_002944	CAGCG	2	10	187533	187542	20 %	0 %	40 %	40 %	41406278
5071	NC_002944	CTA	2	6	187577	187582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406278
5072	NC_002944	ACG	2	6	187588	187593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5073	NC_002944	CGG	2	6	187631	187636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406278
5074	NC_002944	GCA	2	6	187652	187657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5075	NC_002944	TGC	2	6	187771	187776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5076	NC_002944	GCT	2	6	187841	187846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5077	NC_002944	TGA	2	6	187951	187956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406278
5078	NC_002944	GCC	2	6	187969	187974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
5079	NC_002944	ACG	2	6	187987	187992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5080	NC_002944	CTT	2	6	188060	188065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406278
5081	NC_002944	CGGCA	2	10	188076	188085	20 %	0 %	40 %	40 %	41406278
5082	NC_002944	CGT	2	6	188093	188098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5083	NC_002944	CAC	2	6	188120	188125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406278
5084	NC_002944	GCCG	2	8	188159	188166	0 %	0 %	50 %	50 %	41406278
5085	NC_002944	CAT	2	6	188168	188173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406278
5086	NC_002944	GCT	2	6	188201	188206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5087	NC_002944	TGA	2	6	188257	188262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406278
5088	NC_002944	GCT	2	6	188372	188377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5089	NC_002944	GCA	2	6	188417	188422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5090	NC_002944	CGA	2	6	188438	188443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5091	NC_002944	CCG	2	6	188477	188482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
5092	NC_002944	CTG	2	6	188493	188498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5093	NC_002944	GGC	2	6	188524	188529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406278
5094	NC_002944	ACT	2	6	188539	188544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406278
5095	NC_002944	CGA	2	6	188579	188584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
5096	NC_002944	CGA	3	9	188641	188649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406279
5097	NC_002944	CGT	3	9	188653	188661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406279
5098	NC_002944	CCG	2	6	188697	188702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
5099	NC_002944	CGCCGG	2	12	188725	188736	0 %	0 %	50 %	50 %	41406279
5100	NC_002944	GCG	2	6	188799	188804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406279
5101	NC_002944	GCC	3	9	188900	188908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
5102	NC_002944	ACC	2	6	188913	188918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406279
5103	NC_002944	CCG	2	6	188925	188930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
5104	NC_002944	AGC	2	6	188958	188963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406279
5105	NC_002944	AGC	2	6	188977	188982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406279
5106	NC_002944	CCG	2	6	189018	189023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
5107	NC_002944	GTC	2	6	189068	189073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406279
5108	NC_002944	CGG	2	6	189082	189087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406279
5109	NC_002944	GCG	3	9	189121	189129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406280
5110	NC_002944	CAG	2	6	189154	189159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406280
5111	NC_002944	GACGGC	2	12	189163	189174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	41406280
5112	NC_002944	CGC	2	6	189202	189207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406280
5113	NC_002944	GGC	3	9	189283	189291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406280
5114	NC_002944	CGC	2	6	189324	189329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406280
5115	NC_002944	CTT	2	6	189355	189360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
5116	NC_002944	CTT	2	6	189370	189375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
5117	NC_002944	GGCG	2	8	189391	189398	0 %	0 %	75 %	25 %	41406280
5118	NC_002944	CTT	2	6	189400	189405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
5119	NC_002944	CTT	2	6	189415	189420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
5120	NC_002944	TCT	2	6	189438	189443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
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5122	NC_002944	GGCG	2	8	189454	189461	0 %	0 %	75 %	25 %	41406280
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5130	NC_002944	GCC	2	6	189617	189622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_002944	GCC	2	6	189641	189646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5241	NC_002944	CGG	2	6	193776	193781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5242	NC_002944	CG	3	6	193810	193815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5243	NC_002944	CAAGA	2	10	193884	193893	60 %	0 %	20 %	20 %	41406286
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5498	NC_002944	GGC	2	6	201784	201789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406294
5499	NC_002944	TGC	2	6	201807	201812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406294
5500	NC_002944	CAG	2	6	201829	201834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406294

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